【论文一分钟】灵敏度大比拼，SAT比PCR更“高”一筹！
2019-05-24 11:01:00
分类：顶刊鉴析
沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis, CT)和淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae, NG)是全球最流行的两种性传染病，在每年3.57亿新增感染病例中，有1.31亿人感染衣原体，7800万人感染淋病。虽然解脲脲原体(Ureaplasma urealyticum, UU)被认为是泌尿生殖道的共栖菌，但有报道称它与包括非淋球菌性尿道炎(non-gonococcal urethritis, NGU)在内的一些性传播疾病有关，高菌量的UU感染与急性NGU相关。虽然这些感染是可以治愈的，但筛查对于预防这些病原体引起的晚期并发症仍然非常重要。
传统的培养方法主要用于临床标本中CT、NG、UU的检测，但敏感性较低。核酸扩增试验(NAAT)具有较高的敏感性、特异性和易于样品运输的性能，已被美国食品药品监督管理局(FDA)批准用于CT和NG的检测，并广泛应用于临床检测性传染病病原体。核酸扩增试验(NAAT)在世界范围内广泛应用于性传染病病原体的诊断和监测。然而，基于RNA和DNA的NAAT之间的性能差异很少被报道。
军事医学科学院附属医院感染控制科在国际期刊《BMC Infectious Diseases》发表文章，比较了基于RNA的 SAT (simultaneous amplification and testing)和基于DNA的qPCR (quantitative real-time polymerase chain reaction)两种方法的性能。
收集我院门诊疑似生殖器感染患者拭子标本123份。用qPCR检测沙眼衣原体(CT)、淋病奈氏菌(NG)和解脲脲原体(UU)。对qPCR检测中呈阳性的拭子样本通过测序进一步验证。并选取部分样本进行SAT检测。所有统计分析均采用SPSS软件进行
qPCR检测后，分别选择了CT、NG、UU各19例阳性样本和29例阴性样本进行SAT检测，结果如表1所示。SAT和qPCR试验中观察到样品浓度均超过1×103拷贝/毫升。CT、NG、UU的敏感性均为100%，特异性均为100% ，无任何差异。此外，SAT表现出良好的重复性。其中CT、NG、UU的变异系数(CV)分别为1.91、2.94、1.25%，低浓度阳性对照的变异系数(CV)分别为3.14、0.28、2.28%。
对阳性样本稀释至浓度为1×102拷贝/毫升时，在CT、NG和UU检测中，SAT比qPCR有更高的敏感性，结果如表2。其中，14个CT阳性样本中，SAT和qPCR的阳性率分别为57.14%(8/14)和28.57% (4/14)；13个NG阳性样本中，SAT阳性率为46.15%(6/13)，而qPCR结果都为阴性。10个UU阳性样本中，SAT阳性率为80%(8/10) ，而qPCR结果都为阴性。
综上所述，本研究表明与qPCR法相比，SAT法具有较好的一致性和较高的敏感性，可作为筛查、诊断和监测性传播疾病的较好方法，尤其是CT和NG。
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